محققان CIMA از دانشگاه ناوارا یک چالش بین المللی برای تشخیص و ردیابی خودکار سلول ها در فیلم های میکروسکوپی سازماندهی کردند.

دانشمندان مرکز تحقیقات پزشکی کاربردی (CIMA) دانشگاه ناوارا، نتایج اولین چالش یا رقابت بین‌المللی. بین گروه‌های تحقیقاتی را در زمینه تشخیص و ردیابی سلول در ویدئوهای میکروسکوپی دو و سه بعدی ارائه کرده‌اند. این کار که در آخرین شماره مجله بیوانفورماتیک منتشر شدست . علاوه بر ارائه نتایج مسابقه، روش‌های عینی را برای ارزیابی ابزارهای جدید تشخیص و ردیابی سلول‌ها و همچنین یک مخزن مملو از ویدئو در اختیار جامعه بین‌المللی قرار می‌دهد. حاشیه نویسی شد از ریشه های بسیار متنوع. مقاله ردیابی خودکار سلول ها نتایج اولیه چالش را که در سمپوزیوم بین‌المللی مهندسی زیست پزشکی IEEE در سال 2013 در سانفرانسیسکو، کالیفرنیا ارائه شد، شرح می‌دهد.

ردیابی خودکار سلول‌ها در توالی‌های میکروسکوپ فلورسانس در کاربردهای مختلف زیست‌ شناسی پزشکی و باکتری شناسی پزشکی مانند مطالعه متاستاز یا بست شدن زخم و موارد دیگر بسیار مفید است. تا به حال، هر گروه تحقیقاتی با روش‌های تحلیل و مجموعه داده‌های خاص خود کار می‌کردند. بدون اینکه آن‌ها را با سایر تیم‌ها در تضاد قرار دهند، که باعث کاهش عینیت نتایج می‌شود. کار توسعه‌یافته در CIMA یک چارچوب همگن برای ارزیابی الگوریتم‌های ردیابی سلولی پیشنهاد می‌کند.

ردیابی خودکار سلول‌ها

«سهم اصلی کار ما ایجاد یک مخزن کامل از داده های ویدیویی مشروح شدست. که از گروه هایی در اروپا و ایالات متحد ب دست آمدست. دکتر Carlos Ortiz de Solórzano، مدیر پلتفرم توضیح می‌دهد که با اطلاعات به‌دست‌آمده. معیارهای عینی را برای طبقه‌بندی شش الگوریتم از همان تعداد گروه‌هایی که در این چالش شرکت کرده‌اند، تعریف کرده‌ایم. CIMA و چالش ، که با گروه هایی از جمهوری چک و هلند و مراکز دیگری از اسپانیا، آلمان، سوئد و ایالات متحده در آن شرکت کرده اند.

ویرایش دوم چالش در حال حاضر در حال انجام است ، با دادهای جدیدی که مشکلات پیچید تری را برای تجزیه و تحلیل پیشنهاد می کند. نتایج اولیه اخیراً در سمپوزیوم بین المللی IEEE در سال 2014 در زمینه تصویربرداری زیست پزشکی که در پکن (چین) برگزار شد، ارائه شد.
مقالات مشابه : آیا میکروب ها حافظه دارند ؟